Η ΜΠΑ είναι υπεύθυνη από την παρακολούθηση και αξιολόγηση των σχεδίων, προγραμμάτων και δραστηριοτήτων που στηρίζονται από το Πρακτορείο στα πλαίσια των περιφερειακών πλάνων και προγραμμάτων. Εξασφαλίζει την παρακολούθηση των δραστηριοτήτων στήριξης ώστε η χρήση των πόρων που διατίθενται από το Πρακτορείο να είναι σύμφωνη με τον περιφερειακό σχεδιασμό και τα επιχειρησιακά προγράμματα και να υπάρχουν πιο αποδοτικά, δραστικά και βιώσιμα αποτελέσματα. Η ΜΠΑ ασχολείται στενά με τα προβλήματα, τις ανάγκες των δικαιούχων, την επιτυχημένη εφαρμογή των προγραμμάτων και δραστηριοτήτων που στηρίζονται από το Πρακτορείο, τη συμφωνία με τους νόμους και μεθόδους. Καθήκοντα και αρμοδιότητες της ΜΠΑ είναι:
-Παρακολούθηση, επιτήρηση και αξιολόγηση των στηριζόμενων προγραμμάτων και δραστηριοτήτων. Ανακοίνωση των αποτελεσμάτων στο Δ.Σ. και στη Διεύθυνση Κρατικού Σχεδιασμού.
-Αξιολόγηση των προγραμμάτων και δραστηριοτήτων, πριν την έναρξη, κατά τη διάρκεια της εφαρμογής και μετά το πέρας. Αξιολόγηση της προοόδου των δεικτών απόδοσης και συγγραφή περιοδικών εκθέσεων αξιολόγησης.
-Αξιολογήσεις επιδράσεων με σκοπό τη διαπίστωση των επιδράσεων και αποτελεσμάτων των προγραμμάτων του Πρακτορείου, των δραστηριοτήτων που στηρίζει, στην ανάπτυξη της περιοχής και το επίπεδο επιτυχία τους.
-Εξασφάλιση της ορθής και δραστικής χρήσης των πόρων κατά τη διαδικασία εφαρμογής των δραστηριοτήτων και προγραμμάτων που πραγματοποιούνται με την τεχνική ή και οικονομική στήριξη που παρέχει το Πρακτορείο.
-Συμβολή σε συντονισμό με τη Διεύθυνση Κρατικού Σχεδιασμού στο σχεδιασμό της νομικής και θεσμικής υποδομής των όρων που θα πρέπει να υπακούουν οι δικαιούχοι όταν εφαρμόζουν τα προγράμματα και δραστηριότητες, των βασικών αρχών και όρων στην παρακολούθηση και αξιολόγηση των οικονομικών και τεχνικών ενισχύσεων καθώς και στα πρότυπα των εγγράφων και εντύπων.
-Συντονισμός του συστήματος παρακολούθησης πληροφοριών που δημιουργείται για τα στηριζόμενα προγράμματα και δράσεις.
-Προετοιμασία των συμβολαίων που θα υπογραφούν με τους δικαιούχους των προγραμμάτων/δράσεων που εγκρίθηκαν να ενισχυθούν από το Πρακτορείο. Ενεργή συμμετοχή στη διαδικασία υπογραφής.
-Επίσκεψη προπαρακολούθησης σε όσα προγράμματα κριθούν αναγκαία από τον Γενικό Γραμματέα πριν την υπογραφή των συμβάσεων.
-Στη συνέχεια της υπογραφής των συμβάσεων, έλεγχος της ορθότητας των στοιχείων της σύμβασης, αξιολόγηση του δυναμικού του δικαιούχου, προετοιμασία χάρτη εφαρμογής μαζί με τον δικαιούχο του προγράμματος. Γνωμοδότηση στο Γενικό Γραμματέα για την καταλληλότητα προπληρωμής βάσει των αναλύσεων ρίσκου και ανάγκης του προγράμματος καθώς και του ποσού προπληρωμής.
-Εκπαίδευση των δικαιούχων που σε θέματα όπως εφαρμογή προγραμμάτων/δραστηριοτήτων, τρόποι αγορών, χρήση του συστήματος παρακολούθησης πληροφοριών, σύνταξη έκθεσης.
-Στήριξη στους δικαιούχους των προγραμμάτων για την επίλυση των προβλημάτων εφαρμογής.
-Επισκέψεις παρακολούθησης στα στηριζόμενα προγράμματα/ δραστηριότητες.
-Βοήθεια στην επίτευξη των στόχων και σκοπών των προγραμμάτων στην περίοδο εφαρμογής. Εξασφάλιση ότι όλα προχωρούν βάσει των καθορισμένων αρχών και όρων της σύμβασης.
-Διαπίστωση των ρίσκων νωρίς ώστε να ληφθούν διορθωτικά και αποτρεπτικά μέτρα, αν απαιτείται να γίνουν αλλαγές στη σύμβαση και άλλες ενέργειες όπως ακύρωση, επιστροφή πληρωμών κτλ.
-Έλεγχος των εκθέσεων των δικαιούχων και των αιτημάτων πληρωμής, εξασφάλιση τακτικών πληρωμών, έλεγχος αν τα έξοδα γίνονται με σωστό τρόπο.
-Συλλλογή των ερωτήσεων των δικαιούχων για τα προγράμματα ή και δραστηριότητες και ανάρτησή τους μαζί με τις απαντήσεις τους στην ενότητα `Συχνών Ερωτήσεων`(ΣΕ) της ιστοσελίδας.
